Baca juga: Apa Itu Rabun? Reza Arap Salting saat Digoda Soal Fuji di Marapthon 3, Rachel Vennya Terus Pancing Candaan
Menteri Negara Lingkungan Hidup (1998) pada masa Presiden Soeharto
Menteri Pendidikan dan Kebudayaan (1998–1999) pada masa Presiden B. J. Habibie
Menteri Pertahanan (1999–2000) pada masa Presiden Abdurrahman Wahid
Duta Besar Republik Indonesia untuk Inggris (2003–2004) pada masa Presiden Megawati Soekarnoputri
Menteri Pertahanan (2004–2009) pada masa Presiden Susilo Bambang Yudhoyono
Dalam sejarah pemerintahan Indonesia, Juwono dikenal sebagai salah satu tokoh sipil yang memimpin Kementerian Pertahanan setelah jabatan tersebut lama dipegang kalangan militer.

Kepergiannya meninggalkan jejak panjang dalam bidang pendidikan, diplomasi, dan kebijakan pertahanan nasional.